Басқа Орталық Азия елдерімен салыстырғанда Тәжікстан негізінен 1990-шы жылдардың бірінші жартысында болған азаматтық соғысқа байланысты Солтүстік Атлант Шарты Ұйымымен (НАТО) ынтымақтастықты іс жүзінде айтарлықтай кеш орнатты. 1992 жылы Тәжікстан басқа посткеңестік республикалармен қатар кейінірек атауы Еуроатлантикалық әріптестік кеңесі (ЕАӘК) болып өзгертілетін Солтүстік Атлантикалық ынтымақтастық кеңесінің мүшесі болды. Алайда альянстың «Бейбітшілік жолындағы серіктестік» (БЖС) бағдарламасына тек 2002 жылдың ақпанында ғана қосылды.