Kırgızistan, Aralık 1991’de ortaya çıkan ortaklarıyla güvenlik konularını tartışmak ve koordine etmek için Kuzey Atlantik Antlaşması Örgütü (NATO) tarafından bir forum olarak kurulan Kuzey Atlantik İşbirliği Konseyi’ne (KAİK) katıldıktan sonra 1992’de diğer Orta Asya ülkeleriyle birlikte ittifak ile işbirliğini geliştirmeye başlamıştır. Bişkek’in NATO ile pratik işbirliği, Barış İçin Ortaklık (BİO) programının bir çerçeve belgesinin Kırgızistan tarafından imzalanmasıyla Haziran 1994’te başlamıştır. Bu program, Ocak-1994’te Avrupa-Atlantik bölgesinde NATO üyeleri ve üye olmayan ülkeler arasında etkileşimi artırmak için başlatılmıştır.